根抵当権設定の登記については、根抵当権の範囲を登記することになります。
契約書には、「電子記録債権」が記載されていますので、これを忘れないように登記しましょう。

先例が出ているようなので、載せておきます。
　「被担保債権の範囲を『銀行取引　手形債権　小切手債権　電子記録債権』とする根抵当権の設定の登記の申請は，受理をすることができる」平成２４年４月２７日付法務省民二第１１０６号法務省民事局民事第二課長通知）